In anul 1995 PRM a avut o scurta perioada de colaborare cu PDSR, partidul aflat la guvernare. Protocolul de colaborare politica pentru sprijinirea guvernului si sustinere parlamentara a fost semnat la 20 ianuarie 1995 si a tinut pina in octombrie 1995 cind PRM se retrage din alianta cu PDSR, PUNR si PSM ca urmare a greselilor in guvernarea tarii si a ignorarii propunerilor Partidului Romania Mare.
La 15 martie 1995, Partidul Romania Mare a format o alianta politica sub denumirea "Partida Nationala", avand ca parteneri Partidul Roman pentru Noua Societate (presedinte Victor Voichita) si Uniunea Liberala Bratianu (presedinte Ion I. Bratianu). La 6 septembrie 1996 Partidul Romania Mare a fuzionat, prin absorbtie, cu Partidul Roman pentru Noua Societate.
Consiliului National al PRM, din 27 noiembrie 1998, aproba fuziunea cu Partidul Fortelor Democrate ' 89, formatiunea politica a Uniunii Nationale a Organizatiilor de Revolutionari UNORD. Insa la 2 mai 2001 s-a decis denuntarea fuziunii si Biroul Permanent al PRM, la 16 mai 2001, ii exclude, pentru acte de coruptie si indisciplina, pe deputatii Dorin Lazar Maior si Codrin Stefanescu, alesi pe listele PRM.
La inceputul anului 2005, Biroul Permanent al PRM hotaraste anularea aliantei electorale cu Partidul Blocul National Democrat. Decizia a fost luata ca urmare a negocierilor acestui partid cu coalitia de guvernamint. Cei cinci deputati, ai acestui partid, alesi pe listele PRM, au fost exclusi din partid.