La nivel national, potrivit dispozitiilor Statutului, organismele de conducere ale Partidului National Liberal sunt:
Congresul (Adunarea Generala a delegatilor membrilor partidului) este forul suprem de conducere si decizie la nivel national al PNL; Delegatia Permanenta (DP) exercita conducerea partidului in intervalul dintre congrese; Biroul Politic Central (BPC) propune strategia politica a partidului si coordoneaza aplicarea ei; Consiliul National (CN) este forul de dezbatere al Partidului National Liberal la nivel national; Presedintele este garantul infaptuirii Programului politic, al respectarii si aplicarii Statutului si al pastrarii unitatii si prestigiului partidului. Secretarul General asigura comunicarea dintre organismele de conducere la nivel central si filialele teritoriale, asigura gestiunea patrimoniului partidului, raspunde de sistemul informational si de aparatul de lucru.In activitatea sa, Secretarul General este ajutat de Secretari Generali Adjuncti numiti de Biroul Permanent Central la propunerea Secretarului General.
Deasemeni, la nivel national functioneaza, pe baza propriilor regulamente, urmatoarele structuri:
Senatul partidului - organism consultativ al presedintelui cu privire la pastrarea si continuarea traditiilor si la dezvoltarea conceptiilor liberale; Curtea de Onoare si Arbitraj - instanta suprema a partidului; Comisia Centrala de Cenzori - verifica gestiunea partidului; Comisia de Etica - analizeaza candidaturile propuse pentru Alegerile Parlamentare si pentru functiile in Guvern si in administratia publica centrala; Tineretul National Liberal - coordoneaza activitatea specifica a structurilor de tineret constituite la nivelul filialelor teritoriale; Liga Alesilor Locali - coordoneaza metodologic activitatea membrilor PNL din administratia publica locala; Organizatia Femeilor Liberale - coordoneaza activitatea specifica a organizatiilor de femei constituite la nivelul filialelor teritoriale; Cluburile Studentesti Liberale - promoveaza ideile liberale si programul PNL in mediul studentesc, militeaza pentru implicarea studentilor in viata politica.
Organizatiile locale ale Partidul National Liberal au urmatoarele organisme de conducere:
Adunarea Generala a membrilor organizatiei aplica la nivel local masurile necesare realizarii Programului si strategiei partidului; Biroul Permanent - al sectiei de votare, de cartier, comunal, orasenesc sau municipal - planifica, conduce, coordoneaza si monitorizeaza activitatea organizatiei locale in intervalul dintre adunarile generale.